הטיפול הפרטני בייסודו קשר בין שני אנשים, מטפל ומטופל, שתכליתו מתן סיוע נפשי. קיימות גישות שונות וטכניקות מגוונות לקיומו של מפגש זה שמהן נגזר אופיו המיוחד של התהליך הטיפולי. זהו תהליך מורכב המחייב הכשרה אינטנסיבית ורבת שנים של המטפל.
כל המטפלים בתחנת העמקים הינם אנשי מקצוע מיומנים ומורשים העוברים הכשרה והדרכה קפדניים. אנשי הצוות השונים עובדים בגישות שונות, ועל פי מומחיותם, גורם בכיר בתחנה דואג להתאמת המטפל אל המטופל וצרכיו